Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms