Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms