Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek2O35942 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms