Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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MttpO08601 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MttpO08601 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MttpO08601 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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MttpO08601 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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MttpO08601 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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MttpO08601 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MttpO08601 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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MttpO08601 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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MttpO08601 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MttpO08601 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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MttpO08601 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MttpO08601 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MttpO08601 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MttpO08601 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MttpO08601 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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MttpO08601 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MttpO08601 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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MttpO08601 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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