Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mesp2O08574 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mesp2O08574 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mesp2O08574 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mesp2O08574 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp2O08574 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms