Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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