Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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