Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm2888K7N746 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm2888K7N746 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm2888K7N746 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm2888K7N746 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2888K7N746 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms