Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8888J3QPX5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms