Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms