Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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