Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim55G3X8Y1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms