Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4cG3UXD1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms