Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubap1lG3UW59 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms