Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ercc6F8VPZ5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms