Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms