Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox13F6YCR7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms