Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933403O08RikF6UK53 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms