Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms