Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4E9QAP7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4E9QAP7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms