Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms