Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9G1

1700080E11Rik, RIKEN cDNA 1700080E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700080E11RikE9Q9G1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700080E11RikE9Q9G1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms