Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm20518E9Q548 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm20518E9Q548 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm20518E9Q548 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm20518E9Q548 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm20518E9Q548 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm20518E9Q548 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm20518E9Q548 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm20518E9Q548 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm20518E9Q548 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm20518E9Q548 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm20518E9Q548 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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