Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc71lE9Q4T4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc71lE9Q4T4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc71lE9Q4T4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ccdc71lE9Q4T4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ccdc71lE9Q4T4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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