Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms