Protein–RNA interactions for Protein: E9PZN8

Gm5795, Predicted gene 5795, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5795E9PZN8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5795E9PZN8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms