Protein–RNA interactions for Protein: D4PHA7

Wscd2, WSC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wscd2D4PHA7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wscd2D4PHA7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms