Protein–RNA interactions for Protein: D3Z642

4930595D18Rik, RIKEN cDNA 4930595D18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595D18RikD3Z642 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930595D18RikD3Z642 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms