Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ptrhd1D3Z4S3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms