Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30cD3YVI9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms