Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CatipB9EKE5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms