Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms