Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp26c1B2RXA7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms