Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cfap58B2RW38 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms