Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms