Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm11127A7VMS2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm11127A7VMS2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm11127A7VMS2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm11127A7VMS2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm11127A7VMS2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm11127A7VMS2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm11127A7VMS2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm11127A7VMS2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm11127A7VMS2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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