Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1A2ANU3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1A2ANU3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms