Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms