Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdccag3A2AIW0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Sdccag3A2AIW0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sdccag3A2AIW0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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