Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc163A2AGD7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms