Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms