Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms