Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A0U1RNP2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0U1RNP2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms