Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms