Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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TCIRG1Q13488 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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TCIRG1Q13488 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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TCIRG1Q13488 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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TCIRG1Q13488 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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