Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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