Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms