Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
POLKQ9UBT6 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms