Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms