Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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PTPRAP18433 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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PTPRAP18433 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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PTPRAP18433 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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PTPRAP18433 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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